Her sağlıklı yenidoğana Hepatit B aşısı hastaneden ayrılmadan önce tek doz olarak, kas içine uygulanır. Yenidoğana uygulanan aşı takvimi ile vaktinde aşılanmamış büyük çocuğa veya erişkine uygulanacak Hepatit B aşı takvimi ve aşı miktarı aynıdır.
Yenidoğan prematüre veya düşük doğum ağırlığı ile doğmuş ise ağırlığı 2000 gr üzerine çıkana kadar ilk doz uygulaması ertelenir.